Административным центром Ейского района является город Ейск.
 
Гербы и эмблемы имеют также входящие в состав района административно и расположенные в нём территориально следующие муниципальные образования, населённые пункты и др: сп. Александровское, сп. Должанское, сп. Ейское, сп. Камышеватское, сп. Копанское, сп. Красноармейское, сп. Кухаривское, сп. Моревское, сп. Трудовое, сп. Ясенское.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. Район был образован 2 июня 1924 года в составе Донского округа Юго-Восточной области. В его состав вошли территории упразднённых Должанской, Камышеватской, Новощербиновской и Старощербиновской волостей Ейского отдела Кубано-Черноморской области. Первоначально район состоял из 17 сельских советов: Александровского, Воронцовского, Глафировского, Девяткинского, Должанского, Ейского Укрепления, Екатериновского, Камышеватского, Копанского, Кухаревского, Моревского, Новощербиновского, Приазовского, Старощербиновского, Шабельского, Широчанского, Ясенского. С 16 ноября 1924 года район в составе Северо-Кавказского края, с 10 января 1934 года - в составе Азово-Черноморского края. 31 декабря 1934 года из состава Ейского района были выделены Лиманский район с центром в селе Ейское Укрепление и Щербиновский район с центром в станице Старощербиновская. 1 апреля 1935 года из состава района был выделен Камышеватский район с центром в станице Камышеватская. С 13 сентября 1937 года Ейский район в составе Краснодарского края. 4 июля 1939 года город Ейск был отнесён к категории городов краевого подчинения и выведен из состава района, оставаясь его центром. 22 августа 1953 года в состав района вновь вошла территория упразднённого Камышеватского района. 11 февраля 1963 года в состав Ейского района вошла территория упраздненного Щербиновского района. 30 декабря 1966 года Щербиновский район был вновь восстановлен в прежних границах. В 1993 году была прекращена деятельность сельских Советов, территории сельских администраций преобразованы в сельские округа. В 2005 году в районе были ликвидированы администрации сельских округов и образованы 10 сельских поселений. 1 января 2008 года город Ейск и Ейский район были объединены в одно муниципальное образование.