Дата принятия: Флаг Ейского района утверждён решением Совета муниципального образования Ейский район от 28 марта 2006 года №196.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №2262.
Описание: "Флаг Ейского района представляет собой прямоугольное зелёное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее со смещением к древку синюю с белыми границами волнистую диагональную полосу (габаритная ширина полосы равна 4/9 ширины полотнища) и вплотную к ней жёлтую волнистую полосу, габаритная ширина которой 3/5 ширины полотнища; на голубой полосе изображена белая с красными глазом и плавниками фигура стерляди".
Обоснование символики: Флаг разработан на основе герба, в котором отражено название Ейского района – река Ея, вдоль берегов, которой расположен район, а стерлядь, плывущая в синей реке, основной элемент герба города Ейска – центра района, имя которого перешло в район. Кроме того, стерлядь сама по себе отражает рыбные богатства Азовского моря, омывающего район. Голубой цвет – символ чести, славы, преданности, истины, красоты, добродетели и чистого неба. Белый цвет (серебро) – символ простоты, совершенства, мудрости, благородства, мира, взаимосотрудничества. Жёлтая полоса символизирует богатую солнцем и дарами Кубанскую землю, что дополняется зелёным и жёлтым цветом – цветом сельского хозяйства. Зелёный - является символом плодородия, спокойствия, здоровья и вечного обновления. Жёлтый цвет (золото) – символ урожая, богатства, прочности, величия, интеллекта и прозрения.
Авторская группа:
идея: Константин Мочёнов (г. Химки),
художник: Роберт Маланичев (г. Москва),
компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (г. Москва).
Источники.