Административным центром Бабаевского района является город Бабаево.
 
Гербы и эмблемы имеют также входящие в состав района административно и расположенные в нём территориально следующие муниципальные образования, населённые пункты и др.: сп. Борисовское, сп. Володинское, сп. Дубровское, сп. Вепсское, сп. Пожарское, сп. Пяжозерское, сп. Санинское, сп. Сиучское, сп. Тороповское, сп. Центральное.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. Бабаевский район образован по постановлению президиума ВЦИК 1 августа 1927 года в составе Череповецкого округа Ленинградской области созданного на территории упразднённой Череповецкой губернии. Позже в 1927-1928 годах в районе был создан райком ВКП(б). Постановлением ЦИК СССР от 23 сентября 1937 район присоединён к вновь образованной Вологодской области. Указом президиума верховного совета РСФСР в 1959 году к Бабаевскому району была присоединена территория упразднённого Борисово-Судского района. С 13 декабря 1962 года по 12 января 1965 года, вовремя неудавшейся всесоюзной реформы по делению на сельские и промышленные районы и парторганизации, в соответствии с решениями ноябрьского (1962 года) пленума ЦК КПСС «о перестройке партийного руководства народным хозяйством», район в числе многих в СССР был временно укрупнён - был образован Бабаевский сельский район, территория которого включала территорию прежних Бабаевского и Кадуйского административных районов, а город Бабаево, наряду с Устюжной и рабочими посёлками Сазоново и Чагода - временно отошли во вновь образованный Чагодощенский промышленный район. В декабре 1962 года было создано Бабаевское колхозно-совхозное управление и партком этого управления взамен прежнего райкома КПСС, а также и Чагодощенский промышленно-производственный партийный комитет, который в феврале 1964 года был переименован в Бабаевский, а позже, 4 марта 1964 года Чагодощенский промышленный район был упразднён. Пленум ЦК КПСС, состоявшийся 16 ноября 1964 года восстановил прежний принцип партийного руководства народным хозяйством, после чего указом верховного совета РСФСР от 12 января 1965 года Бабаевский и Кадуйский административные районы были восстановлены. Муниципальное образование Бабаевский муниципальный район, образовано на территории и со статусом муниципальный район определённым в областном законе №55-О3 «О муниципальных образованиях Вологодской области» и федеральным законом №131 «Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации», границы муниципального образования Бабаевский муниципальный район определены в областном законе от №1105-ОЗ «Об установлении границ Бабаевского муниципального района, границах и статусе муниципальных образований, входящих в его состав».