Дата принятия: Утверждён решением Думы Пограничного муниципального района от 28.11.2006 года №254.
В Государственный геральдический регистр Российской Федерации внесён под №2894.
Описание: "Флаг Пограничного муниципального района представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из равных зелёной, белой и зелёной вертикальных полос; поверх зелёных полос в середине - дубовые ветки, выполненные жёлтыми и оранжевыми цветами, а поверх белой полосы - красно-зелёный заострённый стилизованный пограничный столб из герба района (шириной в 1/8 от длины полотнища), не доходящий до верхнего края полотнища".
Обоснование символики: Флаг символизирует историко-географические и экономико-политические особенности Пограничного муниципального района. Наименование района напрямую связано с его расположением на границе с Китаем. Это обстоятельство символически отражено на флаге красно-зелёным столбом, характерная раскраска которого указывает на принадлежность его пограничной символике. Дубовые ветки символически отражают богатый природный мир Приморского края, для растительного покрова которого характерно преобладание дубовых лесов. Зелёный цвет - символ весны, плодородия, надежды, возрождения и здоровья. Белый цвет - символ чистоты, света, добра. Жёлтый цвет - символ высшей ценности, величия, богатства, солнечного света. Красный цвет - символизирует красоту, праздник, активность, мужество.
Авторская группа:
идея герба: Анатолий Клыга (п. Пограничный), Александр Харламов (п. Пограничный), Константин Мочёнов (г. Химки);
художник и компьютерный дизайн: Галина Русанова (г. Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (г. Химки).
Источники.