Село Кыштовка является административным центром сельского поселения Кыштовский сельсовет и Кыштовского района.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. Кыштовка расположена на реке Тара. Название «Кыштовка» происходит от слова кыштау (тюрк.) - зимовье. Кыштовка основана переселенцами из европейской части России. Впервые Кыштовка упоминается в 1730 году в рукописи описания земель иртышских татар. В 1870 году Кыштовка стала центром Кыштовской волости Каинского округа Томской губернии, а в 1922 году - центром Кыштовского района Томской губернии. Кыштовское сельское поселение (сельсовет) образовано 25 мая 1925 года.