Административным центром Баганского района является село Баган.
 
Гербы и эмблемы имеют также входящие в состав района админинстративно и расположенные в нём территориально следующие муниципальные образования, нселённые пункты и др.: сп. Ивановский с/с, сп. Палецкий с/с.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. В 1925 на территории нынешнего Баганского района был образован Андреевский район с центром в селе Андреевка в составе Славгородского округа Сибирского края, с 1930 года в составе Западно-Сибирского края. C 1931 по 1935 год район был упразднён. В 1937 году Андреевский район был включён во вновь образованный Алтайский край. В 1944 году район был передан в Новосибирскую область. В 1946 году райцентр был перенесён из села Андреевка в село Баган. В 1963 район был упразднён, в 1965 вновь восстановлен под наименованием Баганский.