Административным центром Цунтинского района является село Кидеро.
 
Гербы и эмблемы имеют также входящие в состав района административно и расположенные в нём территориально следующие муниципальные образования, населённые пункты и др.: Бежтинский с/с.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. Цунтинский район был образован постановлением Президиума ВЦИК СССР от 25 декабря 1930 года из семи сельских советов Цумадинского района с центром в селе Кидеро. В 1935 году райцентр был перенесен в село Шаури. 20 мая 1944 года, в связи с переселением всего населения в Веденский район ЧИАССР после депортации чеченцев и ингушей, постановлением бюро Дагобкома ВКП(б) Цунтинский район как административная единица был ликвидирован, а его территория была передана в административное ведение Цумадинского района. 15 ноября 1955 года Указом Президиума Верховного Совета РСФСР вновь был образован Цунтинский район с центром селе Бежта. В 1992 году райцентр был перенесён в село Кидеро. В соответствии с Постановлением Народного Собрания республики Дагестан от 26 сентября 2013 года №619-V «О внесении изменений в административно-территориальное устройство республики Дагестан» в районе образованы в составе сельсовета «Кидеринский» село Цунта, в составе Бежтинского сельсовета Бежтинского участка села Балакури, Жамод, Исоо.