Село Шеговары входит в состав муниципального образования (муниципальный округ) Шенкурский муниципальный округ.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. Село Шеговары расположено на левом берегу, в излучине Ваги. Село Шеговары было центром Шеговарского прихода, который был образован в 1646 году. Село указано в «Списке населённых мест Архангельской губернии к 1905 году» как деревня Шеговары (Заборье). В административном отношении село входило в состав Шеговарского сельского общества Предтеченской волости Шенкурского уезда. В марте 1918 года село становится административным центром Шеговарской волости, выделившейся из Предтеченской. В ходе реформы местного самоуправления (муниципальная реформа 2004-2006 годов) на территории административно-территориальной единицы "Шеговарский сельсовет" было создано муниципальное образование (сельское поселение) «Шеговарское» с административным центром в селе Шеговары. Законом Архангельской области от 2 июля 2012 года №523-32-ОЗ, муниципальные образования (сельские поселения) «Шеговарское» и «Ямскогорское» упразднены и преобразованы путём объединения в муниципальное образование «Шеговарское», с административным центром в селе Шеговары. Законом Архангельской области в апреле 2022 года муниципальное образование (сельское поселение) «Шеговарское» было упразднено и село Шеговары вошло в состав муниципального образования (муниципальный округ) Шенкурский муниципальный округ.