Деревня Прилуки входит в состав муниципального образования Онежский муниципальный округ.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. Деревня Прилуки находится на левом берегу реки Онеги, при устье реки Шомокши. Первое письменное упоминание (в форме «Прилук») в документах Кожеозерского монастыря за 1606 год. С 1785 года по 1841 год село - центр Прилукской волости Онежского уезда Архангельской губернии. С 1841 года по 1897 год - в составе Мардинской волости, Прилукское сельское общество. С 1897 года по 1919 год - центр Прилукской волости. С 1919 года - центр Прилукского сельского совета Онежского района. С 1992 года - центр Прилукской администрации. В ходе реформы местного самоуправления (муниципальная реформа 2004-2006 годов) деревня Прилуки вошла в муниципальное образование (сельское поселение) "Чекуевское". В 2024 году муниципальное образование (сельское поселение) "Чекуевское" было упразднено и деревня Прилуки вошла в состав муниципального образования (муниципальный округ) Онежский муниципальный округ.