Дата принятия: Флаг района утверждён решением собрания депутатов муниципаьного образования "Мезенский муниципальный район" от 16 июня 2011 года №147 "Об установлении официального символа (флага) муниципального образования "Мезенский муниципальный район". По другим данным утверждён решением собрания депутатов муниципального образования «Мезенский муниципальный район» №255 от 27 декабря 2012 года. Уже существующий флаг Мезенского района решением собрания депутатов Мезенского муниципального округа Архангельской области №97 от 09.02.2023 года был утверждён как флаг Мезенского муниципального округа.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №14337.
Описание:
2011 года: "Флаг муниципального образования «Мезенский муниципальный район» представляет собой прямоугольное светло-серого цвета полотнище с отношением ширины к длине 2:3, с зелёной полосой в 1/5 полотнища вдоль нижнего края. По верхнему краю зелёной полосы изображена червлёная лисица с серебряным брюхом и грудью".
2023 года: "Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух горизонтальных полос: белого (вверху, шириной 4/5 ширины полотнища) и зелёного цветов; в центре белой полосы - идущая по краю зелёной полосы к древку лисица красного цвета с низом морды, грудью и брюхом белого цвета, носом, глазами и кончиком хвоста чёрного цвета".
Обоснование символики: Флаг разработан на основе герба муниципального образования «Мезенский муниципальный район», прошедшего экспертизу в Государственном геральдическом Совете, и отражающего исторические, культурные и экономические особенности Мезенского района. Червлёная лисица с серебряным брюхом и грудью в серебряном поле на зелёной земле символизирует северный город и отражает историю района, связанную с промыслом и торгом пушного зверя. Зелёный цвет - символ природы, изобилия, жизни и возрождения. Серебро в геральдике - символ простоты, совершенства, мудрости, благородства, мира, взаимного сотрудничества. В соответствии с установившимися геральдическими традициями, серебряный цвет поля на флаге заменён на светло-серый.
Источники.