Административным центром Мезенского района является город Мезень.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. Мезенский район образован в июле 1929 года в составе Северного края РСФСР. Постановлением президиума ВЦИК от 10.02.1934 года к Ненецкому округу был причислен Несский сельсовет Мезенского района. В 2022 Мезенский муниципальный район преобразован в Мезенский муниципальный округ (все сельские поселения в его составе утратили муниципальный статус). При этом район как административно-территориальная единица сохранён.