Административным центром Топчихинскго района является село Топчиха.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. 27 мая 1924 года был образован Чистюньский район. В 1924-1925 годах он был в составе Барнаульского уезда Алтайской губернии. В 1925-1930 годах - в составе Барнаульского округа Сибирского края. В 1930-1937 годах - в составе Западно-Сибирского края. В 1932 году район был переименован в Топчихинский. С 1937 года Топчихинский район - в составе Алтайского края.