Село Харагун является административным центром Харагунского сельского поселения Хилокского района.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. Село Харагун основано в 1895 году как разъезд на строящейся Забайкальской железной дороге. В переводе с бурятского харагун - чёрная кобыла. Статус и границы сельского поселения Харагунское установлены законом Читинской области от 19 мая 2004 года «Об установлении границ, наименований вновь образованных муниципальных образований и наделении их статусом сельского, городского поселения в Читинской области».