Дата принятия: Герб и флаг Мышкинского муниципального округа (они же герб и флаг города Мышкина) утверждены 30 мая 2002 года решением собрания депутатов Мышкинского муниципального округа "О гербе и флаге Мышкинского муниципального округа". Согласно новой редакции закона о местном самоуправлении был создан Мышкинский муниципальный район, в состав которого вошло городское поселение город Мышкин. Решением собрания депутатов Мышкинского муниципального района Ярославской области от 28 декабря 2006 года №70 "О внесении изменений в решение собрания депутатов Мышкинского муниципального округа от 30.05.2002 года №17 "О гербе и флаге Мышкинского муниципального округа" флаг бывшего Мышкинского муниципального округа был закреплён за Мышкинским муниципальным районом. Если раньше флаг Мышкинского муниципального округа являлся одновременно и флагом города Мышкина, то с 2006 года этот флаг закреплён исключительно за муниципальным районом.
Описание: "Флаг Мышкинского муниципального округа представляет собой прямоугольное полотнище синего (лазоревого) цвета с соотношением ширины к длине 2:3. В верхнем левом углу в жёлтом поле изображен герб Мышкинского муниципального округа (без зелёного поля), соотношение золотого поля к лазоревому 1:5. Флаг Мышкинского муниципального округа одновременно является флагом города Мышкин".
Источники. Сайт "Аналитический центр администрации Ярославской области".