Дата принятия: Герб и флаг Борисоглебского муниципального округа, а также положения о них утверждены решением №5 "О символике Борисоглебского муниципального округа" собрания представителей Борисоглебского муниципального округа 12 октября 1999 года. Решение подписал глава Борисоглебского муниципального округа А. Н. Корнилов.
Описание: "Флаг Борисоглебского муниципального округа представляет собой белое (серебряное) полотнище, в котором два всадника с копьями-флюгерами. Первый всадник с бородой и усами, одетый в зелёный кафтан, поверх которого красный плащ, брюки и сапоги червлёные (красные), на голове шапка зелёно-червлёная (красная) отороченная натуральным мехом и украшенная серебряными бусинами. Флюгер на копье – червлёный (красный), конь чёрный, седло зелёное, сбруя золотая. Второй всадник одет в червлёный (красный) кафтанв, поверх которого зелёный плащ, на голове шапка червлёно-зелёная, отороченная натуральным мехом и украшенная серебряными бусинами. Флюгер на копье – зелёный. Конь – червлёный (красный), сбруя золотая. Отношене длины полотнища к ширине 3:2 С левой стороны флаг имеет полосу для крепления древка".
Обоснование символики: Два всадника символически изображают князей Бориса и Глеба, убитых братом Святополком. Имя которых носит посёлок Борисоглебский и весь район, когда-то входивший в удел Ростовского князя Бориса. Таким образом флаг говорит о названии района, отражая его историческое прошлое.
Авторская группа:
идея: Констанин Мочёнов (г. Химки);
художник: Роберт Маланичев (г. Москва).
Источники. Сайт "Аналитический центр администрации Ярославской области".