Дата принятия: Утверждён решением наслежного совета депутатов №4 от 27 марта 2021.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №13730.
Описание: "Прямоугольное полотнище соотношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования «Байагантайский 2-й наслег» в белом, зелёном, пурпурном и жёлтом цветах".
Обоснование символики:: Корни дерева – объединение 2 наслегов. Ветви – якутский узор.
Источники.