Дата принятия: Флаг Баппагайнского наслега утверждён решением совета депутатов №68 от 15 июня 2009 года.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №6614.
Описание: "Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Баппагинского наслега в синем, зелёном, жёлтом и белом цветах".
Источники.