Дата принятия: Флаг Алагарского наслега утверждён решением наслежного совета депутатов от 22 марта 2023 года №6.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №14851.
Описание: «Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Алагарского наслега в синем, жёлтом и зелёном цветах».
Обоснование символики: Лазоревый цвет поля символизирует богатое карасями озеро «Чыаппара», где расположен центр Алагарского наслега село Чыаппара. У народа саха, в частности Алагарского наслега, большим уважением пользуется птица - жаворонок (күөрэгэй), так как ещё с советских времён наслег славится своими певцами. Такими, как: Анастасией Петровной Лыткиной - заслуженной артисткой РСФСР и ЯАССР, ещё при жизни названной «якутским жаворонком», Федором Федоровичем Гоголевым - мелодистом, автором гимна Чурапчинского улуса «Ол мин дойдум, Чурапчы!», основателем вокального квартета «Иэйии» - лауреата международных, республиканских конкурсов, Чепаринского мужского народного хора имени Ф. Гоголева - заслуженного коллектива России, и т.д. Жаворонок - птица доброго предзнаменования в народных верованиях. Символизирует не только певческий талант наслега, но и связывается с юношеским задором наслега, порывом радости человека, а также рано пробуждающимся неутомимым тружеником села. Три сердцеобразных растительных орнамента означают любовь, заботу о маленьких, окружённых крутыми холмами, расположенных близко друг от друга Родных Алагарских аласах. Цифра 3 (три) может означать Үс кут (Салгын кут, Ийэ кут, Буор кут), ещё прошлое, настоящее и будущее наслега, его процветание, изобилие, благополучие, счастье.
Источники.