Дата принятия: Герб района утвержден 26 ноября 2001 года решением №82 представительного собрания Усть-Кубинского муниципального района.
Описание: "В зелёном поле - стоящая золотая рысь настороже. В лазоревой главе - два накрест положенных серебряных якоря, поверх которых - золотой лапчатый крест с удлинённым нижним плечом. В левой вольной части - герб Вологодской области".
Обоснование символики: Рысь и зелёный фон символизируют местную фауну и лесные богатства района. Лазоревая глава символизирует озеро Кубенское. Два перекрещенных якоря символизируют речной порт Устье. Золотой крест напоминает о сказании об основании монастыря на острове Каменном. Ладью князя Глеба Васильковича в 1260 году озёрный шторм выбросил на клочок земли среди бурных волн. Возблагодарив Бога за чудесное спасение, Глеб дал обет построить там монастырь - Спасо-Каменный.
Автор: Олег Свириденко (г. Вологда).
Источники. Cтатья О. Свириденко в газете "Русский север"; сайт Культура в Вологодской области.