Село Межениновка является административным центром сельского поселения Межениновское Томского района.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. В соответствии с законом Томской области от 12 ноября 2004 года №241-ОЗ село Межениновка возглавило образованное муниципальное образование Межениновское сельское поселение.