Дата принятия: Утвержден решением Совета Мензелинского муниципального района (№17) от 22 декабря 2006 года.
В Государственный геральдический регистр Российской Федерации герб внесён под №3185.
Описание: Прямоугольное голубое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль верхнего края красную полосу в 1/4 полотнища, посередине голубой части изображение жёлтого летящего кречета из герба района.
Обоснование символики: Флаг района разработан с учётом герба, который основан на историческом гербе уездного города Мезелинска, Высочайше утвержденного 3 июля 1782 года (по старому стилю), описание которого гласило: "Въ верхней части щита гербъ Уфимскiй. Въ нижней - летящiй золотой кречетъ, въ знакъ изобилiя таковаго рода птицъ, въ голубомъ поле". Флаг современного района свидетельствует о преемственности многих поколений и сохранении исторических традиций. Почётная фигура флага - красная полоса вдоль верхнего края символизирует лучшие качества местных жителей - трудолюбие, силу, мужество. Она показывает, что всё, чего добились жители района, сделано их руками с особой любовью и уважением. Голубой цвет - символ чести, благородства, духовности, ясного неба. Жёлтый цвет (золото) - символ изобилия, стабильности, уважения и интеллекта.
Авторская группа:
Разработка флага произведена Геральдическим советом при Президенте Республики Татарстан совместно с Союзом геральдистов России в составе: Рамиль Хайрутдинов (г. Казань), Радик Салихов (г. Казань), Ильнур Миннуллин (г. Казань), Константин Мочёнов (г. Химки), Роберт Маланичев (г. Москва), Кирилл Переходенко (г. Конаково), Оксана Афанасьева (г. Москва).
Источники.