Дата принятия: Утверждён решением Десногорского городского Совет №107 от 28 октября 2009 года.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №5764.
Описание: "Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из шести чередующихся белых и голубых полос, разделённых чешуйчатыми линиями в соотношении 10:1:1:1:1:9, и несущее посередине фигуру из герба города, выполненную красным и жёлтым цветом".
Обоснование символики: Флаг разработан на основе герба города Десногорска. Десногорск - город, который возник при строительстве Смоленской АЭС как посёлок энергетиков. Главная фигура флага - знак атома, отражает особенность становления города и его специфику. Сочетание красного и жёлтого цвета символизируют свет и тепло, которые даёт людям энергия станции. Голубь - символ мира, спокойствия, гармонии подчёркивает мирное служение атома человеку. Город расположен на живописных берегах Десногорского водохранилища, самого крупного в области. На флаге водохранилище отражено волнистыми поясами и переменой цвета, геральдическим приёмом, аллегорически отражающим верхний и нижний бьефы, создаваемые плотиной. Жёлтый цвет (золото) - символ богатства, уважения, стабильности, интеллекта, энергии. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания. Голубой - символ чести, безупречности, преданности, истины. Красный цвет - символ труда, силы, мужества, красоты и праздника.
Авторская группа:
идея: Евгений Котухов, Владимир Морозов, Евгений Кулаков (все Десногорск), Константин Мочёнов (г. Химки);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (г. Конаково);
компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (г. Москва).
Источники.