Дата принятия: Утвержден решением Комитета местного самоуправления (№152-16/4) от 27 декабря 2006 года.
В Государственный геральдический регистр Российской Федерации флаг внесен под №3159.
Описание: Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, разделённое по диагонали на четыре части: желтые, примыкающие к верхнему и нижнему краям и голубые, примыкающие к древку и свободному краю, несущее фигуры герба: посередине полотнища белую ветвь ивы, в голубых частях: у древка белый квадрат, у свободного края желтый с выходящим вверх пламенем.
Обоснование символики: Флаг разработан на основе герба рабочего посёлка, который языком символов и аллегорий отражает природные и экономические особенности Иссы. Посёлок Исса основан на рубеже XVII - XVIII веков и назван по реке, на которой построен. В документах XVII века он упоминается как Иса. Происхождение названия речки и поселения связывают с мордовским "иса" означающем ива, ветла. Изображенная на флаге ветка ивы аллегорически отражает название города, делая композицию флага - гласной. Два ромба, изображённые по бокам ветви, аллегорически символизируют многочисленные карьеры по добыче щебня, известняка и глины, расположенные вокруг рабочего посёлка. Пламенеющий жёлтый (золотой) ромб также аллегорически указывает на произведённую здесь, впервые в Пензенской губернии выплавку чёрного металла. Деление щита на голубые и жёлтые части усиливает природно-экономическую символику флага, указывая на обильные природные ресурсы, ставшие залогом экономического развития Иссы. Жёлтый (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения и интеллекта. Голубой цвет - символ красоту природы, природных просторов, а также безупречности, благородства и духовности. Белый цвет - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Авторская группа:
идея флага: Николай Кузнецов (рп. Исса, Пензенская обл.), Игорь Шишкин (г. Пенза), Константин Мочёнов (г. Химки);
художники: Оксана Фефелова (г. Балашиха), Галина Русанова (г. Москва);
компьютерный дизайн: Галина Русанова (г. Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (г. Химки), Кирилл Переходенко (г. Конаково).
Источники.