Дата принятия: Флаг Морского сельсовета утверждён решением 29-й сессии совета депутатов Морского сельсовета Новосибирского района Новосибирской области №11 от 23 июня 2023 года.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №14860.
Описание: «Прямоугольное полотнище, состоящее из полос синего и жёлтого цветов, с изображением белой рыбы и белой летящей чайки сообразно гербу Морского сельсовета. Отношение ширины флага к его длине 2:3».
Обоснование символики: Рыба (судак) и чайка подчёривают "морской характер" муниципального образования.
Источники.