Дата принятия: Распоряжением мэра Москвы от 17 апреля 2000 года №412-РМ были утверждены гербовая эмблема и флаг Южного административного округа.
Описание: "Флаг Южного административного округа представляет собой прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине как 2:3, диагонально разделёное снизу от древка белой волнистой полосой шириной в 2/15 ширины флага. В верхней, прилегающей к древку, пурпурной части полотнища золотая патриаршая митра. В нижней зелёной части полотнища серебряные ворота Свято-Данилова монастыря".
Обоснование символики: Серебряная волнистая узкая перевязь символизирует Москву - реку, протекающую по территории округа. Золотая патриаршая митра в пурпурном поле символизирует связь духовной и светской жизни. Серебряные ворота Свято-Данилова монастыря в зелёном поле символизируют первую, как в прошлом, так и в настоящем, обитель города Москвы, имеющую статус духовно-административного центра. Два золотых грифона символизируют проходящую по территории округа дорогу в город Севастополь (в гербе которого изображены золотые грифоны). Фигурный мост музея-заповедника "Царицыно" символизирует нахождение на территории округа крупнейшего исторического памятника - загородного дворца Екатерины II.
Источники. Издание "Вестник Мэрии Москвы", №10, май, 2000 год.