Муниципальное округ «Южнопортовый» входит в состав Юго-Восточного административного округа.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. Название происходит от Южного речного порта, который располагается на территории соседнего района Печатники, а также Южнопортовой улицы, которая проходит по границе района. В 1991 году в Москве была проведена административная реформа. Вместо прежних районов были образованы административные округа и в их составе временные муниципальные округа, в том числе и «Южнопортовый», который 5 июля 1995 года получил статус района. 15 октября 2003 года в пределах границ района создано внутригородское муниципальное образование «Южнопортовое». В связи со вступлением в силу новой редакции (2012 года) закона «Об организации местного самоуправления в Москве» муниципальное образование «Южнопортовое» получило статус муниципального округа и название «Южнопортовый».