Муниципальное образование "поселение Марушкинское" входило в состав Новомосковского административного округа.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. В середине XIX века деревня Марушкино относилась ко 2-му стану Звенигородского уезда Московской губернии. В «Списке населённых мест» 1862 года - казённая деревня 1-го стана Звенигородского уезда по правую сторону Ново-Калужского тракта из Москвы на село Нара Верейского уезда при речке Марушке. По данным на 1899 год - деревня Перхушковской волости Звенигородского уезда. По материалам всесоюзной переписи населения 1926 года - центр Марушкинского сельсовета Перхушковской волости Звенигородского уезда. В 1929-1930 годах - населённый пункт в составе Звенигородского района Московского округа Московской области. В 1930-1963, 1965-2012 годах - в составе Наро-Фоминского района Московской области. В 1963-1965 годах - в составе Звенигородского укрупнённого сельского района Московской области. В 1994-2006 годах - центр Марушкинского сельского округа. В 2004 году в состав деревни был включён посёлок ОПХ «Толстопальцево». В рамках реформы местного самоуправления и в соответствии с законом Московской области от 28 февраля 2005 года №72/2005-ОЗ «О статусе и границах Наро-Фоминского муниципального района и вновь образованных в его составе муниципальных образований» на территории Наро-Фоминского муниципального района было образовано муниципальное образование "сельское поселение Марушкинское", в состав которого вошли 15 населённых пунктов позже упразднённого Марушкинского сельского округа. Муниципальное образование "сельское поселение Марушкинское" (административный центр - деревня Марушкино) 01 июля 2012 года вошло в состав Новомосковского административного округа города Москва как внутиргородское муниципальное образование "поселение Марушкинское". По принятому в 2024 году закону (в рамках административно-территориальной реформы в Новомосковского административном округе) города Москва муниципальное образование "поселение Марушкинское" упразднено, его территория вошла частями в состав муниципальных образований "муниципальный округ Филимонковский" и "муниципальный округ Внуково". Правопреемником муниципального образования "поселение Марушкинское" являются органы местного самоуправления и управа "района Внуково".