Муниципальный округ «Лефортово» входит в состав Юго-Восточного административного округа.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. В середине XVII века в Москве на правом берегу Яузы (в современном Басманном районе) царь Алексей Михайлович воссоздаёт Немецкую слободу. Среди иностранных офицеров, служащих в России и проживающих в слободе, Пётр I находит многих соратников, в том числе уроженца Женевы Франца Лефорта. Считается, что район был основан в 1699 году. До революции район назывался Лефортовской слободой в честь Франца Лефорта, рядом находилась Немецкая слобода. В XVIII веке в Лефортово и рядом с ним строится целый ряд дворцов для дворян и царских особ: Лефортовский и Слободской дворцы (оба на правом берегу Яузы, ныне Басманный район), Головинский дворец, Анненгоф, Екатерининский дворец, дача Строгановых. В 1866-1868 годах была построена Московско-Курская железная дорога. Вместе с ней были построены главные вагонные мастерские, из которых впоследствии сформировался нынешний завод имени Войтовича. В 1881 году в Лефортово была построена первая сортировочная станция Московско-Рязанской железной дороги и депо Москва-Сортировочная. В том же году открывается Лефортовская тюрьма. В 1941 году был создан Калининский район (в честь М. И. Калинина). В 1979 году по району проходит Калининская линия метро. Распоряжением мэра Москвы №146-РМ от 12.09.1991 года район переименован в муниципальный округ «Лефортово» и включён в состав Юго-Восточного административного округа, по закону города Москвы №13-47 от 05.07.1995 года - в район «Лефортово». 15 октября 2003 года преобразован во внутригородское муниципальное образование «Лефортово». В ходе административных реформ (2012-2015 годов) муниципальное образование «Лефортово» преобразовано в муниципальный округ «Лефортово» в городе Москва.