Муниципальный округ «Капотня» входит в состав Юго-Восточного административного округа.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. На территории современного района ранее располагалась деревни Чагино и Рязанцево, а также село Капотня. Первое упоминание села Капотня (ранее - села Капотненского) встречается в духовной грамоте, датированной 1336 годом, по которой великий Московский князь Иван Данилович Калита завещал старшему сыну - будущему великому князю Симеону Гордому - село Капотненское. В дальнейшем село часто упоминается в духовных грамотах Московских князей Симеона Гордого, Ивана Красного, Дмитрия Донского. С первой половины XV века село принадлежало Николо-Угрешскому монастырю, который располагался поблизости. В середине XVII века в Капотне была построена деревянная церковь, впоследствии замененная в 1789 году каменным храмом, который был освящён в том же году на праздник Рождества и стал называться Храмом Рождества Пресвятой Богородицы. В 20-х годах XVII века Московский уезд был разделён на три части, одна из которых - Замосковская - в свою очередь была разделена на две. В той, что находилась к востоку от Москвы, образовался Капотненский стан, прозванный так по названию села. Позднее Капотня входила в Ухтомский уезд. В 1918 году село Капотня было преобразовано в посёлок. В рамках своей исторической планировки посёлок просуществовал до 1930-х годов, а после возведения вблизи него нефтеперерабатывающего завода в 1954 году посёлок был переименован в «рабочий посёлок». В 1960 году указом верховного совета РСФСР №437 от 18 августа 1960 года в связи со строительством кольцевой автодороги был внесён в городскую черту города Москва. Район «Капотня» был образован 5 июля 1995 года. 15 октября 2003 года преобразован во внутригородское муниципальное образование «Капотня». В ходе административных реформ (2015-2017 годов) муниципальное образование «Капотня» преобразовано в муниципальный округ «Капотня» в городе Москва.