Дата принятия: Утверждён решением Подольского городского Совета депутатов №11/22 от 30 июня 2006 года.
Описание: "Прямоугольное голубое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль верхнего края красную полосу в 1/5 ширины полотнища и посередине голубой части две жёлтые скрещенные кирки из герба округа. В торжественных случаях к древку флага (под навершием) может прикрепляться лента Ордена Трудового Красного Знамени длиной не более 1/2 длины полотнища".
Обоснование символики: Флаг разработан с учётом герба, созданного на основе исторического герба уездного города Подольск Московской губернии Высочайше утверждённого 16 марта 1883 года (по старому стилю). Использование фигур исторического герба показывает историческую, культурную и геральдическую преемственность, подчёркивая богатые традиции и наследие жителей городского округа. Красная полоса показывает территориальную принадлежность к Московской области. Жёлтый цвет (золото) – символ урожая, богатства, стабильности, уважения и интеллекта. Голубой цвет – символ чести, благородства и духовности. Красный цвет – символ мужества, силы, трудолюбия, красоты и праздника.
Авторская группа:
идея: Константин Мочёнов (г. Химки);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (г. Конаково);
художник и компьютерный дизайн: Галина Русанова (г. Москва).
Источники.