Дата принятия: неизвестна, но не позднее 2010 года.
Описание: "Прямоугольное полотнище соотношением ширины к длине 2:3, в центре которого расположено изображение герба, оно делит полотнище флага на две половины. Правая и левая части окрашены переменными цветами симметрично по отношению к изображению герба".
Обоснование символики: Флаг разработан на основе герба муниципального образования «Сернурский муниципальный район», геральдическое описание которого гласит: «В рассечённом серебром и зеленью поле подобная острию оконечность переменных цветов, сопровождаемая по сторонам двумя сообращёнными стоящими птицами с воздетыми крыльями; вершина оконечности заканчивается выступающим вилообразным крестом, в соединении два раза ромбовидно уширенным и с дважды гаммированными вовнутрь штамбовыми плечами». Композиция флага района составлена из древнемарийских космологических символов - мирового древа (древа жизни) и птиц. Элементы символики выполнены в традиционном стиле марийской вышивки. Представление о мировом древе (и священной роще) как сложном прообразе мира, как символе мирового устройства и мифологическом объекте, соединяющем верхний средний и нижний миры, а также о священной водоплавающей птице как вестнике богов, сохранилось в марийской национальной культуре до наших дней. Это особенно характерно для северо-восточного региона Марий Эл, в частности, для сернурской стороны. Дерево символизирует бессмертие, вечность, жизненность, ибо черпает энергию из основных природных стихий: корни - из земли и воды, крона - от солнечных лучей из воздуха. Птицы согласно геральдической традиции, косвенно указывают на преемственность по отношению к историческому гербу Уржумского уезда, в состав которого входила территория района. Птицы в геральдике - символ солнца, ветра, полёта души, свободы, счастья, а также означают плодородие (женскую основу). Белый цвет (серебро) означает чистоту миролюбие, белый свет. Зелёный цвет - символизирует надежду, богатство природы. Цвета соответствуют марийской орнаментальной традиции, характерной для сернурской стороны. Переменность цветов — геральдическое объединение орнаментального знака и полей полотнища.
Источники. Официальный сайт Сернурского района, 2010 год.