Дата принятия: Флаг района и Положение о флаге муниципального образования Куженерский муниципальный район Республики Марий Эл утверждены Решением Собрания депутатов Куженерского МР от 28 июня 2006 года №194.
Описание: Флаг муниципального образования "Куженерский муниципальный район" Республики Марий Эл представляет собой прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее сокращенную композицию герба района: в красном поле скачущий белый лось с золотыми крыльями, рогами и копытами; оконечность - три белые ели, средняя из которых выше.
Источники. Официальный сайт Куженерского муниципального района.