Административным центром Темрюкского района является город Темрюк.
 
Гербы и эмблемы имеют также входящие в состав района административно и расположенные в нём территориально следующие муниципальные образования, населённые пункты и др.: сп. Ахтанизовское, сп. Вышестеблиевское, сп. Голубицкое, сп. Запорожское, сп. Краснострельское, сп. Курчанское, сп. Новотаманское, сп. Сенное, сп. Старотитаровское, сп. Таманское, сп. Фонталовское.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. На территории современного района в древности существовали поселения, в том числе знаменитая Гермонасса-Тмутаракань, в разное время контролировавшиеся Боспорским царством, Византией, Хазарией, Тмутараканским княжеством, Генуей, Крымом и Османской Империей. В XVIII веке территория района вошла в состав Российской Империи. В 1792 году здесь были поселены черноморские казаки. Территория района входила в Таманский (позже названный Темрюкским) отдел Кубанской области. Темрюкский район основан в 1924 году. С 1963 года по 12 января 1965 года территория Темрюкского района входила в состав объединённого Анапского района. День района отмечается ежегодно 9 октября.