Дата принятия: Флаг Фонталовского сельского поселения утверждён Решением совета Фонталовского сельского поселения Темрюкского района II созыва от 30 августа 2010 года №67.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №6468.
Описание: "В лазоревом поле, вписанное опрокинутое золотое остриё, обременённое бьющим из оконечности фонтаном о шести струях в цвет поля".
Герб Фонталовского сельского поселения может воспроизводиться в многоцветном и одноцветном равнодопустимых вариантах. Герб Фонталовского сельского поселения в одноцветном варианте может воспроизводиться с шафировкой (условной штриховкой для обозначения цветов). Герб Фонталовского сельского поселения в соответствии с Методическими рекомендациями по разработке и использованию официальных символов муниципальных образований (Раздел 2, Глава VIII, пп. 45-46), утверждёнными Геральдическим советом при Президенте Российской Федерации 28.06.2006 года может воспроизводиться со статусной короной установленного образца.
Обоснование символики: Композиция герба Фонталовского сельского поселения указывает на природные, географические особенности муниципального образования. Деление поля герба на голубые и золотую части образно показывают северную и южную границы сельского поселения, которые проходят по берегам Темрюкского и Таманского заливов Азовского моря. Сочетание золотых и голубых частей символизируют природные богатства края: золото – символ урожая, плодородия, стабильности, солнечного света и тепла благоприятного для виноградарства; голубой цвет – символ морских просторов, обильных рыбой. Золото это также цвет песка фонталовских пляжей, привлекающих массу приезжих своим уютом и комфортом. Фонтан символизирует известный с древних времен источник пресной воды, столь редкий для этих мест. Во многом благодаря наличию пресной воды эти места были освоены человеком несколько тысячелетий назад. Фонтан в гербе гласно отражает название станицы и всего поселения, делая композицию герба гласной.
Авторская группа:
идея: Совет Фонталовского сельского поселения;
геральдическая доработка: Константин Мочёнов (г. Химки), Анатолий Раков (г. Краснодар);
художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (г. Москва);
обоснование символики: Совет Фонталовского сельского поселения, Кирилл Переходенко (г. Конаково).
Источники. Сайт администрации Фонталовского сельского поселения.