Административным центром Прионежского района является город Петрозаводск, в состав района не входящий.
 
Гербы и эмблемы имеют также входящие в состав района административно и расположенные в нём территориально следующие муниципальные образования, населённые пункты и образования: Веппская волость, сп. Рыборецкое.
 
Прионежский район образован в соответствии с декретом ВЦИК от 29 августа 1927 года о районировании РСФСР. В октябре 1930 года, согласно декрету ВЦИК, был упразднён. Территория вошла в состав Петрозаводского района, функции управления осуществлял Петрозаводский городской совет. В 1933 году вновь организован Прионежский район под управлением Прионежского районного комитета.