Дата принятия: Флаг Коткозерского сельского поселения утверждён Решением Совета Коткозерского сельского поселения от 26 августа 2013 года №79.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №8763.
Описание: "Прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к длины 2:3, воспроизводящее композицию герба в зелёном, синем, белом и жёлтом цветах".
Обоснование символики: По одной из версий Коткозеро получило название от финского слова "котка" - орёл. По другой версии - от саамского "куотку" - узкая полоска земли между озёрами или болотами. Флаг поселения напоминает об обеих версиях лингвистической трактовки слова Коткозеро. Серебро символизирует чистоту помыслов, искренность, правдивость, надежду, непорочность, благородство. Золото - величие, постоянство, прочность, солнечный свет. Зелень - радость, жизнь, возрождение природы каждую весну, плодородие. Лазурь - красота, любовь, мир, возвышенные устремления.
Источники.