Дата принятия: Флаг Багратионовского района утверждён решением №63 районного совета депутатов 18 июня 2003 года. Решением совета депутатов Багратионовского городского округа от 29 ноября 2006 года №79 "О внесении изменений в решение о гербе и о флаге Багратионовского района" герб и флаг бывшего Багратионовского района стали гербами Багратионовского городского округа. Сами символы не изменились. Решение вступило в силу со дня опубликования в газете "Новая жизнь", №93, 13 декабря 2006 года.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №1296.
Источники. Справочно-правовая система "Гарант".