Дата принятия: Утверждён решением Думы муниципального района от 28.08.2009 года №277.
В Государственный геральдический регистр Российской Федерации герб внесён под №5732.
Описание: "Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух горизонтальных полос - белой и голубой (1:3) и воспроизводящее посередине белой полосы изображение чёрного, обернувшегося на бегу, соболя, а посередине голубой - изображение белого скачущего оленя с чёрными глазами".
Обоснование символики: Территория Качугского района - своеобразный музей Иркутской области под открытым небом. В Качугском районе находится более 300 памятников истории и архитектуры, в том числе древние могильники и знаменитые Шишкинские писаницы. На берегу реки Лены, в 3 км выше деревни Шишкино на спускающихся к воде скалах хорошо видны уникальные рисунки-петроглифы. Впервые их описал участник Великой Северной экспедиции Степан Крашенинников в 1736 году. Подробно изучавший петроглифы известный советский археолог, академик Алексей Окладников отнёс "писаницы" к эпохе палеолита - времени зарождения первобытного искусства. На одном из наскальных рисунков изображён конный воин со знаменем в руках. Это изображение стало основой герба Республики Саха (Якутия). Аналогичные рисунки можно видеть и у деревни Картухай, близ которой в скале находится пещера со следами древней стоянки. В ней и по сей день, находят костяные и железные наконечники стрел, предметы быта древних людей. Всего на скалах в верховьях Лены нарисовано почти 2 тыс. рисунков. Сцены охоты, быта, картины переселения народов легли на природное полотно, протяженность которого 3,5 км. На флаге Качугского района стилизованное изображение фигурок соболя и оленя - аллегория наскальных рисунков, символ памятников истории и архитектуры здешних мест. Соболь - символ процветания Сибирских земель, поскольку именно пушнина как "мягкое золото" манила в далекие неизведанные края первопроходцев. Олень - символ богатой фауны здешних лесов, основа жизнедеятельности проживающих в Качугском районе представителей коренного малочисленного народа Севера - эвенков. Белая полоса над голубым полем - аллегория нового пешеходного подвесного моста через реку Лену - предмет особой гордости жителей Качуга. Длина пролета моста составляет 126 м, ширина - 2 м. Раньше жители Качуга пользовались понтонным мостом. Содержание его было весьма затратным для муниципального бюджета. Каждую осень мост разбирали, а весной собирали и ремонтировали. С постройкой нового пешеходного моста сообщение между частями района стало круглогодичным. Голубой цвет (лазурь) - символ всех водных ресурсов района (рек, речушек, озёр), символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения. Чёрный цвет символизирует благоразумие, мудрость, скромность, честность. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, ясности, открытости, божественной мудрости, примирения.
Авторская группа:
идея флага: Е. Какоулина (Качугский район);
геральдическая доработка: Константин Мочёнов (г. Химки);
художник и компьютерный дизайн: Ирина Соколова (г. Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (г. Химки).
Источники.