Дата принятия: Флаг Бабагайского муниципального образования утверждён решением думы муниципального образования "Бабагайское сельское поселение" от 25 октября 2018 года №10/4.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №12110.
Описание: "Флаг муниципального образования представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, на всю поверхность которого распространена композиция из герба муниципального образования с заменой геральдического золота и серебра соответственно жёлтым и белым цветами".
Источники.