Дата принятия: Флаг района был вместе с новым гербом утверждён в один день, 30 июня 2003 года, решением №215 Уйского районного совета депутатов.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №1264.
Описание: "Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, разделённое на четыре прямоугольные равные части: вверху у древка и внизу у свободного края - синие, остальные жёлтые; несущее в центре изображения фигур из герба района: красный шар, белая деревянная крепость в виде башни с кровлей, вырастающая из-за угла палисада".
Пояснение: Синий цвет символизирует многочисленные озёра и источники района, жёлтый - является символом золотоносных месторождений. Деревянная крепость воспроизводит вид первой Уйской крепости, а красный круг подчёркивает факт нахождения Уйского района в географическом центре Челябинской области.
Авторская группа: Союз геральдистов России во главе с К. Ф. Мочёновым совместно с автором первого герба района Татьяной Погребниковой и Виктором Таборских (с. Уйское).
Источники. Книга К. Ф. Мочёнова, Г. А. Туник "Официальные символы Челябинской области и муниципальных образований", Челябинск, 2004 год.