Административным центром Муйского района (бур. Муяын аймаг) является посёлок городского типа Токсимо.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. Муйский район образован в 1989 году за счет выделения северной территории Баунтовского и восточной территории Северобайкальского районов Указом Президиума Верховного совета РСФСР от 23 октября 1989 года и постановлением Президиума Верховного Совета Бурятской АССР от 20 июля 1989 года.