Административным центром Губкинского района является город Губкин.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. В 1931 году первая разведочно-эксплуатационная шахта положила начало промышленному освоению богатств открытой ещё в 18 веке Курской магнитной аномалии (КМА), и на месте деревни Коробково возник населённый пункт, который в 1939 году получил статус рабочего посёлка с присвоением имени И. М. Губкина. Промышленное освоение месторождений КМА было начато в 1952 вводом в эксплуатацию на Коробковском месторождении опытного рудника имени Губкина. 6 января 1954 года рабочий посёлок Губкин был передан из Курской области в состав новообразованной Белгородской области. В 1955 году горнорудный посёлок Губкин получил статус города. В 1993 году город Губкин и сельский Губкинский район (был образован из Старооскольского и Боброводворского районов) были объединены в единое муниципальное образование.