Дата принятия: Флаг Гафурийского района утвержден решением Совета муниципального района Гафурийский район Республики Башкортостан от 18 июля 2006 года № 9-76з.
В Государственный геральдический регистр Российской Федерации герб внесён под №3210.
Описание: "Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, состоящее из трех вертикальных полос зеленого, белого и зеленого цвета, соотносящихся как 1:3:1, переходящих грядой бегущих вниз геральдических волн; в центре белой полосы – фонтан с пятью струями синего цвета".
Обоснование символики: В самом центре Башкортостана, на исторических землях обитания Табынских и Юрматинских башкир, вдоль берегов красавицы Агидели, на склонах седого Урала расположена земля гафурийцев. Центральной фигурой герба является лазоревый фонтан, олицетворяющий неповторимую красоту края, его богатство уникальными целебными источниками, сероводородом и лечебными грязями. Редкое сочетание природных факторов, лечебные силы "святых" источников позволили открыть на территории района курорт "Красноусольск" известный далеко за пределами республики. Лазоревый овал символизирует Белое Озеро - уникальный памятник природы Башкортостана. Богатство района лесом и плодородие почвы символически изображены в виде зеленых деревьев с золотым орнаментом "кускар". Зеленый цвет также означает изобилие, радость, покой и мир. Соединенные тамги Кесе, Кальсер - табынцев и юрматинцев символизируют народную память и почитание своей истории. Серебряное основное поле герба является символом веры, духовности, благородства, чистоты и искренности, в полной мере свойственных трудолюбивому многонациональному народу района. Золотой орнамент "кускар" - символ земледелия, скотоводства, которыми гафурийцы занимались издревле и поныне.
Автор: Салават Гилязетдинов.
Источники. Сайт "Государственного Собрания - Курултая Республики Башкортостан".