Село Яндыки является администравтивным центром сельского поселения "Яндыковский сельсовет" Лиманского района.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. Основание села связано с подписанием Императором Николаем I 30 декабря 1848 года указа О заселении дорог на калмыцких землях Астраханской губернии, согласно которому на калмыцких землях предполагалось учредить 44 станицы. Официально село было создано в 1853 году. Яндыки являлись ставкой Яндыковского улуса вплоть до 1889 года, когда Яндыковский улус был объединён с Мочажным ведомством в Яндыко-Мочажный улус, а ставка улуса перенесена в Долбан. До 1927 года село Яндыки оставалось в составе Астраханской губернии. Постановлением президиума ВЦИК 9 мая 1927 года Яндыковский сельский совет Бирючекосинского района Астраханской губернии в целях преодоления чересполосицы был передан в состав Яндыко-Мочажного улуса Калмыцкой автономной области. С 1935 года - село в составе Долбанского улуса Калмыцкой АССР. 28 декабря 1943 года калмыцкое население было депортировано. Село Яндыки, как и другие населённые пункты Долбанского улуса Калмыцкой АССР, передано в состав Астраханской области. 6 августа 2004 года в соответствии с законом Астраханской области №43/2004-ОЗ установлены границы муниципального образования, сельсовет наделен статусом сельского поселения.