Дата принятия: Флаг муниципального образования "село Болхуны" утверждён решением совета муниципального образования "село Болхуны" от 20 февраля 2020 года №3.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №12968.
Описание: "Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры герба муниципального образования "село Болхуны", выполненые зелёным, синим, жёлтым и белым цветом. Обратная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую".
Обоснование символики: Флаг муниципального образования "Село Болхуны" составлен на основе герба муниципального образования "Село Болхуны". Флаг муниципального образования "Село Болхуны" отражает географическое расположение и окружающую природу поселения. Волнистое деление флага и его синяя часть символически показывают расположение села на берегу реки Ахтубы. Внизу флага изображены противообращённые заяц и плотва, символически показывая то, что в окрестностях поселения обитают многочисленные виды животных и птиц. Плотва символизирует не только обилие рыбы в Ахтубе но и то, что местное население издавна занимались рыболовством. Символические значения цветов: Жёлтый цвет (золото) - символизирует знатность, могущество и богатство, а также христианские добродетели: веру, справедливость, милосердие и смирение. Белый цвет (серебро) - символ совершенства, благородства, чистоты помыслов, мира. Синий цвет (лазурь) символизирует красоту, верность, доверие, безупречность, а также развитие, движение вперёд, надежду, мечту, великодушие, честность, верность и безупречность. Зелёный цвет - символ природы, здоровья, жизненного роста, молодости и надежды.
Авторская группа:
идея: Валентина Клячина (с. Болхуны);
геральдическая доработка: Константин Мочёнов (г. Химки);
художник: Оксана Афанасьева, Ольга Салова (обе – г. Москва);
компьютерный дизайн: Ольга Салова (г. Москва);
обоснование символики: Сергей Панченко (с. Болхуны).
Источники. Сайт "город Ахтубинск", 2013 год.