Дата принятия: Утверждён решением Зейского городского собрания Амурской области от 02.09.1999 года №65.
В Государственный геральдический регистр внесён решением геральдического совета при президенте России от 31.05.2001 года №5 под №660.
Описание: "Флаг разработан на основе герба города Зеи, утверждённого решением Зейского городского собрания от 02.09.1999 №65 «Об утверждении герба и положения о гербе города Зеи». Герб города Зеи внесён в государственный геральдический регистр России под № 660 (решение геральдического совета при президенте России от 31.05.2001 года №5). Символика Флага имеет то же значение, что и в гербе. Синее поле Флага символизирует реку Зея, давшей имя городу. Возникновение города в 1879 году связано с открытием месторождений золота в бассейне Зеи, что отражено во флаге золотой восьмилучевой звездой на синем фоне. Современное развитие города связано с Зейской ГЭС, аллегорически изображённой в виде серебряной молнии - символе энергетики. Зелёный цвет поля символизирует предприятия лесной промышленности и природу, плотно окружающую город. Зелёный цвет - символ здоровья, благополучия и надежды. Голубой (синий) цвет - символ чести, славы, преданности, истины, красоты и величия. Серебро - символ простоты, совершенства, мудрости, благородства, мира, взаимосотрудничества. Золото - символ прочности, богатства, великодушия, интеллекта и прозрения".
Источники.