Дата принятия: Утверждён Решением Ельцовского Районного Совета депутатов от 22.12.2016 года №39.
В Государственный геральдический регистр России внесён под №11129.
Описание: "Прямоугольное двухстороннее полотнище белого цвета с отношением ширины к длине 2:3, на котором красным, белым, серым, жёлтым, оранжевым, зелёным и синим цветом, изображены фигуры из герба Ельцовского района".
Обоснование символики: Ельцовский район расположен на востоке Алтайского края, его жители первыми в крае встречают начало нового дня, что на флаге района отражено возникающим солнцем. Район богат природными ресурсами, в том числе мрамором (Пуштумилский мраморный карьер). Мраморная ваза - символическое отражение применения природных богатств района. Красный (червлёный) столб - символ многочисленных автомобильных трасс связывающих район с посёлками и городами Алтайского края и Кемеровской области. Зелёно-голубая лента - символ многочисленных таёжных рек протекающих по территории района, в том числе Чумыш, Ельцовка, Маховка, Бобровка, Шалап, Неня. Цветовое решение полотнища и его фигур дополняют символику флага:
- белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения;
- красный цвет (червлень) - символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника;
- жёлтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая;
- синий цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения;
- зелёный цвет символизирует весну, здоровье, природу, молодость и надежду.
Авторская группа:
идея: Олег Попов (Ельцовский район);
вексиллологическая доработка: Константин Мочёнов (г. Химки);
художник и компьютерный дизайн: Анна Гарсия (г. Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (г. Химки).
Источники.