Дата принятия: Флаг Чойского района утверждён решением совета депутатов муниципального образования «Чойский район» №9-3 от 19 декабря 2019 года.
Описание: «Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования "Чойский район" с изменением - без изображения камня в сиянии на зелёной полосе, и выполненный в жёлтом, зелёном, бордовом, голубом и белом цветах. Оборотная сторона флага является зеркальным отображением его лицевой стороны».
Авторская группа:
идея: Т. Плотоненко (с. Сёйка, Чойский район);
геральдическая доработка: Ю. Росич (г. Москва);
компьютерный дизайн: А. Карпова (г. Барнаул), Ю. Росич (г. Москва).
Источники.